换一批草酸青霉线性五肽生物合成的比较转录组分析
Comparative Transcriptome Analysis of Linear Pentapeptide Biosynthesis in Penicillium oxalicum
摘要草酸青霉(Penicillium oxalicum)是一种重要的植物生防菌,从三峡河岸带分布的草酸青霉中,分离到一种线性五肽,该物质对柑橘致腐菌指状青霉(P.digitatum)具有极强的抑制作用.为了分析该五肽的生物合成机制,本研究采用BGISEQ-500平台,测定了3株不同五肽含量的草酸青霉(114-2,SG-4,S J-3)cDNA文库,并使用参考基因组对序列进行了比较.高通量测序结果表明,3株草酸青霉平均产出了6.55 GB的序列数据,与有参转录组的平均比对率达到91.65％.差异表达基因比较分析表明,相较于不产五肽的114-2,在生产五肽的SG-4和SJ-3中,共有1648个基因上调表达,1251个基因下调表达.AntiSMASH分析表明,在草酸青霉基因组中可能存在33个非核糖体肽合成酶(NRPS),其中15个NRPS的表达与五肽物质的变化趋势一致.进一步的RT-PCR表达分析表明,基因簇PDE 01071可能是负责五肽合成的基因簇.
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