换一批基于ITS2序列及二级结构对紫苏与其变种、紫苏子与其混伪品的鉴别
Molecular Identification of Perilla frutescens and Its Varieties,Perillae fructus and Its Adulterants Based on ITS2 Primary Sequence and Its Secondary Structure
摘要采用ITS2 一级序列联合其二级结构对紫苏与其变种、紫苏子与其混伪品进行鉴定,为紫苏药材的使用提供更科学的分类方法.收集紫苏与其近缘种、紫苏子混伪品基源植物样本,提取DNA进行PCR扩增;并结合GenBank中的序列获得所有物种的ITS2序列.应用MEGA7.0软件进行序列分析、计算种内种间遗传距离、构建NJ树,利用ITS2数据库预测各物种的ITS2二级结构.利用4Sale软件进行一级结构联合二级结构矩阵的比对,运用ProfDistS软件构建PNJ树.ITS2序列的扩增成功率高.除白苏以外,紫苏与其他变种的ITS2序列具有明显的Barcoding gap;NJ树显示,ITS2可将紫苏、白苏与其他变种区分;紫苏和白苏在ITS2二级结构中有差异.紫苏子与其混伪品的ITS2序列差异较大,种间具有显著的遗传距离,NJ树和PNJ树显示紫苏子与各混伪品分别各自聚为一支,且有较高的自展支持率.因此,基于ITS2条形码可以准确鉴别紫苏子与其混伪品,为规范药材市场和保障临床用药安全提供可靠方法;但对于紫苏与其变种白苏的鉴别需要结合ITS2二级结构,或建议将白苏和紫苏合并为一个种,为紫苏属的植物分类提供参考.
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分类号
R282.5（中药学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1673-1689.2022.04.012
发布时间
2022-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
陕西省科技厅自然科学基础研究计划项目（2021JQ-782）
陕西省教育厅专项项目（21JK0900）
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