宏基因组分析新疆北部地区马乳中菌群结构及功能基因
Metagenomic Analysis of Microbial Community Structure and Functional Genes in Horse Milk from Northern Xinjiang
摘要[目的]马乳营养价值高且风味独特,这与其复杂的微生物构成密不可分,而不同的地理位置、气候会对马乳菌群结构产生影响,作者探究了不同地理位置对马乳菌群结构的影响.[方法]基于宏基因组技术分析新疆北部3个不同地区14批马乳样品(每批为12匹马的马乳混合样)的微生物多样性,挖掘其功能基因.[结果]共鉴定出26种微生物,分属于9门14纲25目28科45属,优势菌种有瑞士乳杆菌、巴氏醋酸杆菌、弯曲乳酸杆菌、酒香酵母;不同地区共有11个属,优势菌属均为乳杆菌属,优势菌种均为瑞士乳杆菌,但不同地区相对丰度存在差异;与鲜马乳相比,发酵马乳中乳杆菌属、醋菌属、短乳杆菌属、酒香酵母属的相对丰度增加,而链球菌属、土孢杆菌属、葡萄球菌属、肠球菌属、弯曲杆菌属、克雷伯氏菌属的相对丰度降低;KEGG数据库注释到23 547个基因,涉及碳水化合物代谢、氨基酸代谢、翻译过程、膜运输、能量代谢、核苷酸代谢、辅助因子和维生素的代谢;eggNOG数据库注释结果表明,马乳细菌中含有丰富的与复制重组和修复相关的基因,以及与碳水化合物运输和代谢、氨基酸运输和代谢等相关的基因;马乳细菌中含有丰富的糖苷水解酶、糖基转移酶基因,基因数分别为12 155 454和1 130 442.其次是氧化还原酶基因及糖类酯解酶基因,基因数分别为184 638和465 134.[结论]不同地理位置会对马乳菌群结构产生影响,不同马乳类型菌群结构也存在差异.
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