茯苓中麦角-7,22E-二烯-3β-醇的靶点蛋白PRGR的结构分析与功能预测
Structural Analysis and Functional Prediction of PRGR,a Target Protein of the Poria Ergosta-7,22E-dien-3β-ol
摘要[目的]应用生物信息学和分子对接方法研究茯苓甾醇类活性成分麦角-7,22E-二烯-3β-醇与孕激素受体(PRGR)的互作机制及其潜在的治疗作用.[方法]利用TCMSP数据库筛选茯苓的有效成分,使用MEGA X(10.0.5)对PRGR蛋白序列进行多重比对,通过ProtParam分析PRGR蛋白的一级结构,Protscale预测PRGR蛋白的疏水性,Prosite分析PRGR蛋白的氨基酸序列,通过NPS@SOPMA网站分析PRGR蛋白的二级结构,运用RCSB PDB数据库结合同源建模方法预测PRGR蛋白的三级结构,通过DeepLoc-2.0网站预测PRGR蛋白的亚细胞定位,运用SwissDock网站对茯苓有效成分麦角-7,22E-二烯-3β-醇与其潜在靶点孕激素受体(3O5Q)进行分子对接验证.[结果]PRGR蛋白由933个氨基酸组成,相对分子质量98 980,理论等电点 6.09,属于亲水性不稳定蛋白质;其二级结构以无规卷曲(占比 70.31%)为主,并含有核受体配体结合域(NR LBD)及C4型锌指结构,提示其在核信号传导中的核心功能.麦角-7,22E-二烯-3β-醇通过疏水相互作用及氢键锚定于PRGR配体结合口袋,关键结合位点涉及亮氨酸(Leu)、丙氨酸(Ala)等残基.PRGR在灵长类中高度保守,与人类亲缘关系最近的物种(黑猩猩、倭黑猩猩)分支值达98%以上;PRGR可能通过细胞核及线粒体外膜参与免疫调控,分子对接显示麦角-7,22E-二烯-3β-醇与PRGR蛋白可能形成稳定的复合物.[结论]阐明了茯苓中甾醇类成分与PRGR的分子结合机制,为靶向PRGR的免疫调节药物开发及药食同源资源的精准利用提供理论支撑,同时为天然产物-核受体互作研究提供新思路.
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