换一批PD-L2蛋白B细胞表位预测及其与PD-1结合的三维结构分析
The mapping of B-cell epitopes of human PD-L2 and their three-dimensional positions
摘要目的:对人源程序性死亡因子1配体2(PD-L2)的B细胞表位进行预测及其与PD-1结合的三维结构分析.方法:采用生物信息学分析软件及服务器上的在线分析系统预测人类PD-L2蛋白的二级结构,柔性区域,Hopp&Woods亲水性、Zimmerman极性参数和Jameson-Wolf抗原指数以及Emini表面可及性方案等,预测结果被用以对PD-L2的优势B细胞表位区段进行多方面分析.运用抗原指数分析,预测PD-L2的B细胞表位.使用BLAST分析人源PD-L2与小鼠PD-L2的同源性,将人源PD-L2的B表位与小鼠PD-L2的序列进行匹配.将与人源PD-L2表位匹配的序列在小鼠PD-1与小鼠PD-L2的结合模型上定位,对其立体结构进行模拟,进一步直观地分析B细胞表位与蛋白结合位点的关系.结果:PD-L2的全长氨基酸序列共含有273个氨基酸,相对分子质量为31 kDa的可溶性蛋白;经综合分析,其B细胞优势表位可能为氨基酸序列N端的60~72、93~97、133~139、164~171区段.模拟立体结构分析显示表位60~72区段"QKVENDTSPHRER"位于PD-1与PD-L2的结合区域内.结论:利用生物信息学预测发现PD-L2的优势B细胞表位中,60~72、93~97、133~139、164~171区段为PD-L2的B细胞表位,其中表位60~72区段"QKVENDTSPHRER"位于PD-1与PD-L2的结合区域内.可为PD-L2抗体设计和研究提供理论基础.
更多相关知识
关键词
程序性死亡因子1程序性死亡因子配体2B细胞表位立体结构programmed cell death 1programmed cell death 1 ligand 2B-cell epitope3D structure
分类号
R6（外科学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.2095-9400.2018.05.002
发布时间
2018-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
- 浏览172
- 被引0
- 下载12
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
