换一批2013年西安地区柯萨奇病毒A6流行情况及基因特征
Circulation status and genetic characteristics of coxsackievirus A6 in Xi'an in 2013
摘要目的 研究2013年西安地区普通手足口病(HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CA6)的流行情况及其基因特征.方法 从2013年采集的普通HFMD病例标本中随机挑选250份非肠道病毒71型(EV71)非柯萨奇病毒A16型(CA16)的其他肠道病毒核酸阳性者,利用实时荧光逆转录酶联聚合反应检测CA6,扩增部分阳性标本VP1 (viral protein,VP)基因,并测定序列,与CA6其他参考序列比对,进行进化分析.结果 在250份样本中CA6阳性者共191份,阳性率为76.4％.进化分析显示西安地区2013年CA6与近年来流行于世界各地的CA6新变种同源性较高,而与原型株进化距离较远.序列比对发现本地毒株VP1与CA6新变种核苷酸序列相似性在89.7％～97.5％,编码氨基酸相似性为96.0％～99.7％;与CA6原型株及2006年以前中国大陆分离株核苷酸相似性为82.3％～83.8％,氨基酸相似性为93.8％～94.9％.结论 2013年西安地区HFMD普通病例病原以CA6为主,流行株为近年来流行于全球各地的CA6新变种.
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关键词
手足口病(HFMD)病原柯萨奇病毒A6型(CA6)进化分析hand-foot-mouth diseaseaetiological agentcoxsackievirus A6 (CA6)phyletic evolution
栏目名称
DOI
10.7652/jdyxb201404014
发布时间
2014-08-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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