Notch家族成员遗传学变异预示乳头状甲状腺癌高复发风险
Genetic alteration of Notch family members as a predicting factor for poor prognosis in papillary thyroid cancer
摘要目的 分析Notch家族成员在乳头状甲状腺癌(PTC)中的表达及预后的相关性,探讨其参与肿瘤复发的可能机制.方法 下载TCGA数据库中PTC患者的临床资料及mRNA Seq芯片数据,采用cBioPortal在线分析Notch家族成员在正常甲状腺组织及不同TNM分期PTC中的表达情况,其遗传变异与PTC无复发生存期的相关性,同时采用KEGG进行差异基因信号通路聚类分析.结果 在PTC组织标本中NOTCH1、NOTCH3、NOTCH4 mRNA较非甲状癌甲状腺组织表达上调,而NOTCH2表达无显著变化.将PTC标本组织根据TNM分期分组后,NOTCH1、NOTCH3、NOTCH4 mRNA表达呈现先升后降趋势,NOTCH2则相反.携带Notch家族成员遗传变异(包括基因扩增、删失、错义突变及mRNA表达异常)的PTC患者无病生存期较短.通过对差异基因进行信号通路聚类分析,发现Notch成员遗传学异常与包括PI3K/Akt及MAPK信号通路在内的多条肿瘤信号通路均存在交互作用.结论 Notch家族成员异常预示PTC高复发风险,相关机制可能与细胞代谢及PI3K/Akt、MAPK等信号通路活性异常有关.
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