换一批食管癌组织ARL5B表达与临床病理特征的关系及作用机制
Expression and clinicopathologic features of ARL5B in esophageal cancer and its mechanism
摘要目的 应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制,并通过临床资料、基础实验等进行了初步验证.方法 从TCGA数据库下载食管癌数据集,R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析.取临床食管癌及癌旁组织标本,采用实时定量PCR(qRT-PCR)及蛋白印迹(Western blotting)验证ARL5B表达.免疫组化检测ARL5B表达并评价其与食管癌患者临床病理特征的关系.利用生物信息学对ARL5B潜在作用机制初步分析,qRT-PCR初步验证可能与其作用的基因.结果 生物信息学结果显示ARL5B在人食管癌组织中的表达明显高于癌旁组织且ARL5B高表达是食管癌患者预后差的标志.淋巴结组织、肿瘤组织、癌旁组织中,ARL5B的mRNA和蛋白的表达由高到低,与生物信息学结果符合.临床分析表明ARL5B表达与肿瘤的淋巴结转移、临床分期有关,其高表达是患者预后差的标志.富集分析显示ARL5B与囊泡传输、内体传输、细胞器定位等生物学过程有关.蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析提示与ARL5B互作的蛋白质有VPS16、KIF1A、TOM1等.qRT-PCR验证表明,VPS16、KIF1A、TOM1的mRNA在食管癌组织中表达高于癌旁组织(n=60)且与ARL5B表达呈正相关.结论 食管癌中ARL5B存在高表达,与肿瘤淋巴结转移、临床分期及预后有关;ARL5B可能通过多种分子机制调控参与食管癌进展.
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关键词
食管癌ADP-核糖基化样因子5B(ARL5B)临床病理学特征Kaplan-Meier法生物信息学分析esophageal cancerADP ribosylation factor like GTPase 5B(ARL5B)clinicopathologic featureKaplan-Meier analysisbioinformatics analysis
分类号
R735.1（消化系肿瘤）
栏目名称
DOI
10.7652/jdyxb202402010
发布时间
2024-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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