摘要目的:探讨宏基因组二代测序技术在儿童包裹性脓胸诊疗过程中的应用价值.方法:选取甘肃省第二人民医院2019年1月至2020年12月间收治的确诊为包裹性脓胸患儿,通过内科胸腔镜下抽取脓液、取活检组织等操作,获得测序样本进行宏基因组(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)感染病原高通量检测.通过宏基因组二代测序技术探究儿童包裹性脓胸发病特点和感染病原微生物特征,来达到指导临床治疗的目的.结果:选取本院48例确诊包裹性脓胸儿童患者,男22例、女19例,中位年龄5.0(0.7～14)岁.其中以血液病为原发病患儿有9例,以重症肺炎为原发病患儿有22例,以肺部感染为原发病患儿有10例,以不明原因出现肺部阴影患儿7例.采集上述48例儿童包裹性脓胸样本并通过mNGS检测发现,由单一细菌引起的有6例(14.63％),由单一真菌引起的有2例(4.88％),由单一病毒引起的有5例(12.20％),混合感染的有28例(68.29％),混合感染中病原菌有9例.通过对感染病原体和可疑病原体基因组覆盖度统计发现,细菌种属中肺炎链球菌、铜绿假单胞菌、粪肠球菌、鲍氏不动杆菌和结核分支杆菌的基因组覆盖度相对较高(P<0.05);病毒种属中人类疱疹病毒、EB病毒、小细环病毒基因组覆盖度相对较高(P<0.05);黄曲霉菌、耶氏肺孢子菌、念珠菌、鹦鹉热衣原体基因组覆盖度也相对较高(P<0.05).通过对mNGS检测结果为阳性病例资料的单因素分析,显示确诊为包裹性脓胸的患儿病例资料中性别、年龄、白细胞计数、中性粒细胞和淋巴细胞比例、降钙素原以及C反映蛋白数值对于采用mNGS检测的病原体检出率无影响.结论:采用宏基因组二代测序技术可以根据基因组覆盖度、拷贝浓度梯度、检出病原体分型以及载量高灵敏特点,以期更好地指导儿童高危病原体感染的预防和规范临床用药.