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新城疫病毒V4株NP和P基因及其间隔区序列的克隆与分析

Cloning and sequencing of NP gene,P gene and intergenic region in NP and P gene coding region junction of Newcastle disease virus V4 strain

摘要采用RT-PCR技术克隆了新城疫病毒(NDV)V4株长约4 200 bp的核苷酸序列,并进行了序列测定与分析.结果表明,该序列中包含有NDV V4株NP基因编码区、NP和P基因间隔区以及P基因的全部核苷酸序列.NDV V4株NP和P基因与其他8个NDV毒株相应部分进行同源性比较,与Quuesland V4株的同源性最高.NDV V4株NP和P基因间隔区序列与其他13株NDV毒株相应部分的比较结果表明,F48E9等强毒株较La sota等弱毒、无毒毒株和试验用V4株在这个区域多了6个碱基,这6个碱基插入的位置在La sota等弱毒、无毒毒株全基因组序列的1 647~1 648 nt处;参比的14株NDV在这个区域的同源性为63.9%~100%,弱毒株之间的同源性较高,弱毒株与强毒株之间及强毒株之间的同源性差异较大.

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