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H9N2禽流感病毒陕西分离株HA基因的遗传变异分析

Genetic variation analysis of HA gene of H9N2 Avian Influenza Virus isolates from Shaanxi Province

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摘要[目的]对H9N2禽流感病毒HA基因全序列进行分析,了解H9N2禽流感分离毒株HA基因的遗传变异情况.[方法]根据GenBank已发表的H9N2毒株的基因序列,设计了2对H9N2禽流感病毒HA基因特异性引物,运用RT-PCR方法对XL、LF和WN分离株进行了扩增,然后将PCR产物送出进行测序,用DNAstar 5.0软件对测序结果进行了分析.[结果]XL、LF和WN 3株H9N2分离株间HA基因的核苷酸同源性为99.7%～99.9%,推导氨基酸的同源性为99.1%～99.6%;分离株与参考毒株HA基因核苷酸的同源性为96.2%～99.0%,推导氨基酸的同源性为96.2%～98.6%.通过对3个H9N2分离株间HA基因核苷酸序列的比较,发现共有5个位点的核苷酸发生突变,其中4个位点核苷酸的改变导致相应的氨基酸发生突变.HA蛋白的7个受体结合位点比较保守,但是其在551～553位缺失了潜在的糖基化位点.[结论]3株H9N2分离株裂解位点氨基酸序列完全符合低致病性禽流感的特征 RSSR↓G,但是LF裂解位点附近333位脯氨酸(Pro)突变为组氨酸(His),即非极性氨基酸向极性带正电氨基酸(碱性氨基酸)转变,裂解位点的变化可能是H9N2禽流感病毒生物学特性改变的分子基础.