换一批幽门螺杆菌黏附素AlpA保守区基因的克隆、序列测定及其生物信息学分析
Cloning, sequencing and bioinformatic analysis of AlpA conservative region gene of Helicobacter pylori
摘要目的克隆幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)4种黏附素(babA、alpA、alpB和hopZ)基因的保守区, 并对其进行序列及生物信息学分析.方法利用ANTHEPROT V4.3c 软件, 分析已证实的Hp 4种黏附素蛋白序列, 发现4种黏附素的C-端氨基酸存在保守区. 选取AlpA的C-端结构基因序列作为引物进行PCR, 将PCR产物定向插入载体pET-22b(+), 以DNA自动分析仪进行序列测定, 并以生物信息学软件分析其生物学特性.结果克隆片段的长度为588 bp, 与发表的黏附素AlpA保守区基因的序列完全一致.ANTHEPROT V4.3c软件预测其蛋白质的Mr约为22 500, 并显示出良好的抗原性和疏水性.结论用PCR方法, 从幽门螺杆菌ss1中获取到黏附素AlpA保守区的基因序列, 为研究Hp黏附素的分子机制和免疫原性奠定了基础.
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医学主题词
幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)计算生物学(Computational Biology)序列分析(Sequence Analysis)基因(Genes)软件(Software)
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1007-8738.2002.06.008
发布时间
2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家高技术研究发展计划（863计划）（102-07-03-06;30170890,30270078）
军队医药卫生科研项目（OIMA-132）
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