HPV58 E6的基因克隆及HLA-DQB1*03限制性T细胞表位分析

Clone of HPV58 E6 gene and analysis of HLA-DQB1 * 03 restricted T-cell epitopes

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摘要目的:克隆HPV58 E6的基因,并对其HLA-DQB1*03限制性T细胞表位进行分析.方法:从宫颈癌组织中提取基因组DNA,通过PCR方法扩增HPV58 E6基因,常规方法将目的基因插入pGEM-T Easy载体中.酶切和测序鉴定后,利用位置特异性分数矩阵(PSSM)理论、支持向量机(SVM)理论和蛋白酶体酶切位点预测算法分析HPV58 E6的HLA-DQB1 *03限制性T细胞表位.结果:成功克隆了1株HPV58 E6基因(GenBank EF060239),表位47 FADLRIAYRDGNPFA和表位102 RCIICQRPLCPQEKK理论上是其HLADQB1*03限制性T细胞表位.结论:这两个表位可望作为后续相关实验中表位筛选、鉴定和多肽疫苗研制的候选对象.

作者陈凌 ^[1] 沈柱 ^[2] 伍津津 ^[1] 张菊 ^[3] 周杨 ^[2] 范雪莉 ^[4] 学术成果认领

作者单位第三军医大学大坪医院野战外科研究所皮肤科,重庆,400042 ^[1] 第四军医大学西京医院皮肤科,陕西,西安,710032 ^[2] 第四军医大学全军基因诊断研究所,陕西,西安,710032 ^[3] Department of Medicine,University of Massachusetts Medical School,Worcester,MA 01605,USA ^[4]

关键词 HPV58 E6 基因克隆 T细胞表位

主题词表位(Epitopes)基因(Genes)细胞(Cells)性(Sex)方法(Methods)

分类号 Q781

栏目名称 基础研究

DOI 10.3321/j.issn:1007-8738.2007.11.004

发布时间 2007-12-24

基金项目

国家自然科学基金