换一批
换一批互信息关联模型在基因调控网络构建中的应用
The mutual information correlation model's application in construction of gene regulatory net-work
摘要目的 基因的表达受其它基因的影响较大,基因之间相互影响、相互制约的关系构成了复杂的基因表达调控网络.本研究基于基因表达的时空特性,寻求一种新的描述基因表达调控网络的方法.方法 根据信息熵确定属性权重,对各时间点进行加权聚类;根据互信息相关理论,确定相关系数,分析基因之间的调控关系.结果 得到各基因之间的调控矩阵,进一步进行图像可视化.结论 利用信息熵理论得到信息熵相关系数后,可以根据两两基因之间信息熵相关系数的大小确定基因之间的调控关系,从而得到基因之间的生物学关系.该方法计算简便,结果更为合理,可以从整体上了解生物细胞的生长过程,把握基因之间的相互关系,特别是对于发现基因的新功能有较好的效果,并为进一步的生物学实验提供了相关依据.
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主题词
基因调控网络(Gene Regulatory Networks)基因(Genes)熵(Entropy)方法(Methods)基因表达调控(Gene Expression Regulation)
栏目名称
基础医学研究
DOI
10.3969/j.issn.1672-3511.2018.01.003
发布时间
2018-03-09
基金项目
国家自然科学基金
陕西省自然科学基金
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