换一批
换一批杜梨铵转运蛋白基因的克隆表达及在梨属植物中的SNP分析
Cloning and Expression Analysis of an Ammonium Transporter Gene in Pyrus betulaefolia and Its SNP Analysis in Pyrus
摘要利用EST并结合RACE方法从杜梨幼苗克降获得1个AMT基因(PbAMT1；2).分析显示,PbAMT1；2cDNA全长1 811 bp,开放阅读框为1 515 bp,其对应基因组DNA序列不含内含子.PbAMT1；2编码的蛋白由504个氨基酸组成,具有11个跨膜域,1个N-糖基化位点、3个酪蛋白激酶磷酸化位点和8个蛋白激酶C磷酸化位点.同源性分析发现,PbAMT1；2与其他植物的AMT具有较高的一致性,其中与百脉根LjAMT1；2的一致性为80.23%,与拟南芥AtAMT1；2的一致性为78.68%,与番茄LeAMT1；2的一致性为77.80%.系统进化树分析表明,PbAMT1；2属于AMT1亚家族.半定量RT-PCR结果显示,PbAMT1；2主要在根部表达,而在茎和叶中几乎没有表达.以杜梨、豆梨、砂梨、白梨、秋子梨和西洋梨等6种梨属植物的DNA为模板,高保真Taq酶PCR扩增AMT1；2基因ORF区DNA序列,发现6种梨属植物的AMT1；2ORF区DNA序列长度均为1 515 bp,相似性高达99.48%,但在44个核苷酸位点中存在SNPs,导致18个氨基酸位点发生变异,多态性频率为1SNP/34.43 bp,核苷酸变异度为2.9%,氨基酸变异度为3.57%.
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