换一批29份云南甘蔗创新种质的SSR遗传多样性分析和指纹图谱构建
Genetic Diversity and Construction of Fingerprint of 29 Yunnan Germplasms of Sugarcane Innovation by SSR
摘要该研究以16份甘蔗骨干亲本为参照,对29份云南甘蔗创新种质进行SSR指纹图谱构建和遗传多样性分析,以明确创新种质与16份亲本间的遗传基础和多样性水平.结果表明:6对引物共扩增出104条带,其中101条为多态性条带,多态性条带比例为97.25％;45份材料的遗传相似性系数为0.235 3～0.891 3,平均值为0.563 3;其中16份甘蔗骨干亲本的遗传相似性系数为0.301 6～0.755 6,甘蔗创新种质与甘蔗骨干亲本的特异条带比例为14∶1,涵盖了割手密、大茎野生种、斑茅和滇蔗茅等基因源.根据骨干亲本间的相似性系数范围,在相似性系数为0.43处,可将种质分为6大类群,亲缘关系相对较远,适宜作为种质间的杂交利用.通过引物区分效率分析,6对引物扩增的多态信息量为0.9679～0.9758,其中MSSCIR21引物区分效率最高,利用MSSCIR21和SMC1047HA引物组合构建了云南甘蔗创新种质标准指纹图谱,在相似性系数为0.85处即可区分所有种质,图谱的鉴别准确率为100％,每份资源都有唯一的指纹图谱,可将29份创新种质和16份骨干亲本区分鉴别出来.该研究能够为后续杂交利用、种质鉴定和知识产权保护提供依据.
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DOI
10.7606/j.issn.1000-4025.2015.12.2414
发布时间
2016-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家科技支撑计划（2013BAD01B00）
云南省应用基础研究计划（2006C0013Z）
云南省中青年学术和技术带头人后备人才培养项目（2009C1059）
农作物种质资源保护项目（2015NWB017）
国家科技基础条件平台建设计划（NICGR2015-044）
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