换一批
换一批龙眼miR171家族进化特性及其表达分析
Evolutionary Characterization and Expression of miR171 Family in Dimocarpus longan Lour
摘要为了解龙眼miR171家族的进化特性及其功能,该研究以龙眼mRNA和miRNA数据库中获得的miR171家族7个前体序列(pre-miRNA)和9条成熟体序列为基础进行生物信息学预测和表达分析.mfold预测显示,pre-miR171家族成员均能形成典型二级结构,其最小折叠自由能(dG)介于-39.37~-55.13 kal/mol,且家族成员中除pre-miR171-scaffold112和pre-miR171f-scaffold38外,其他成员包含的成熟序列与vvi-miR171a、ptc-miR171f以及ctr-miR171等成熟体完全匹配.NJ进化树分析发现,龙眼pre-miR171家族与柑橘、毛果杨具有较高相似性.psRNAtarget靶标预测显示,龙眼miR171家族的主要靶标为Scarecrow-like 6,与其他植物的miR171靶标相同.实时荧光定量PCR分析表明,pre-miR171家族成员均在龙眼雄花中表达提高,而在果实中表达量降低.研究认为,龙眼miR171家族在进化过程中具有高度保守性,在龙眼生长发育过程中主要参与雄花形成.
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关键词
龙眼miR171生物信息学实时荧光定量Dimocarpus longan Lour.miR171bioinformaticsreal-time fluorescence quantification
栏目名称
研究报告
DOI
10.7606/j.issn.1000-4025.2017.02.0258
发布时间
2017-04-10
基金项目
福建省自然科学基金杰出青年项目
国家自然科学基金
福建省重大专项
福建省新世纪人才项目
福建农林大学"杰出青年科研人才"培养专项基金
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