换一批棉花EIN3/EIL家族基因序列分析及GhEIL3基因克隆
Sequence Analysis of EIN3/EIL Gene Family and Cloning of GhEIL3 in Cotton
摘要该研究以拟南芥AtEIN3基因为探针,从陆地棉TM-1全基因组测序数据库中筛选其同源序列,序列分析得到16条具有EIN3结构域的基因序列.对陆地棉EIN3/EIL家族基因的基因结构、系统进化、序列相似性及结构域分布情况进行分析,发现它们与拟南芥EIN3/EIL家族基因在N端具有较高相似度,其中15条基因序列包含5个保守结构,1条包含4个保守结构.在此基础上,采用RT-PCR方法从抗枯萎病的陆地棉品种'中棉所12'中克隆得到一个新的EIN3/EIL家族基因,命名为GhEIL3(GenBank登录号为KY072936).序列分析表明:GhEIL3基因开放阅读框长1 092 bp,编码363个氨基酸,含有一个EIN3结构域.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,GhEIL3基因在枯萎病菌诱导后呈上调表达,诱导后1 h其相对表达量达到最大值,推测GhEIL3基因可能参与棉花对枯萎病菌的防御反应.
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DOI
10.7606/j.issn.1000-4025.2017.03.0445
发布时间
2017-05-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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