甜荞柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3的克隆及表达分析
Cloning and Expression Analysis of FeFRD3 Citrate Efflux Transporter Gene in Fagopyrum esculentum
摘要该研究采用同源克隆策略,从甜荞中克隆到1个柠檬酸转运蛋白基因FeFRD3(GenBank登录号为MG462907).FeFRD3基因含一个1 554 bp开放阅读框,编码517个氨基酸,预测蛋白分子量为55.83 kD,等电点为8.48.生物信息学分析显示,FeFRD3蛋白含有8个跨膜区,定位于质膜和液泡膜上.蛋白序列分析结果表明,FeFRD3与拟南芥、大豆和水稻的FRD3同源蛋白有较高的序列一致性.系统进化树分析表明,FeFRD3属于具有将铁由根向地上部位长距离转运功能的柠檬酸转运蛋白,且与拟南芥AtFRD3亲缘关系最近.qRT-PCR分析结果表明,FeFRD3基因在甜荞根、茎、叶和种子中均有表达,但在根中的表达量最高,在种子中的表达量最低;缺铁胁迫没有影响FeFRD3基因在根中的表达,但高铁胁迫明显诱导了该基因在根中的表达.研究结果为进一步深入研究FeFRD3基因在甜养铁长距离转运中的功能奠定了基础.
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