换一批基于多因子降维法的子痫前期易感基因-基因交互作用研究
The application of multifactor dimensionality reduction for detecting gene-gene interac-tions in pre-eclampsia
摘要目的:了解子痫前期(PE)易感基因多态性(SNP)在中国人群中的分布特点,探讨SNP与PE遗传易感性之间的关系;应用多因子降维法(MDR)分析SNPs的交互作用,以期建立PE的多基因预测模型用于疾病风险的评估.方法:收集深圳地区中国汉族PE患者156例与正常妊娠妇女286例,SnapShot技术进行基因型鉴定,用卡方检验进行单位点关联分析,MDR法分析基因-基因交互作用;并构建多位点logistic模型.结果:(1)经Buffarrony校正后,eNOS基因rs2070744等位基因频率分布在中国汉族人群中有统计学差异,PE组"C"等位基因频率明显高于对照组(C vs T:χ2=8.852,P=0.003).(2)中国汉族人群中暂未发现rs1800580、rs5742620、rs6020、rs1799963、rs1799889、rs4986791、rs4986790、rs268位点存在多态性.(3)最佳交互作用模型包含EPAP2(rs2549782)、GSTP1(rs1695)、AGT(rs4762)、IL-10(rs1800896)、APOE(rs7412)和TNF-alpha(rs1800629、rs1799724).训练样本准确率为0.7294,验证样本准确率为0.5853,交叉验证一致性为10/10(P=0.001).(4)基于MDR结果构建的logistic回归模型结果显示,rs1800896、rs1799724、rs2070744、rs4762及rs7412位点有统计学意义.结论:中国汉族人群PE风险遗传因素具有人种特异性;MDR方法是对PE的多因素效应估计的新尝试,6个PE易感基因存在交互作用,可能对中国人群PE的发病起重要作用.
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分类号
R711.71（妇科学）
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DOI
10.13283/j.cnki.xdfckjz.2018.01.001
发布时间
2018-01-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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