换一批基于3D Slicer应用程序构建大鼠小脑外形微细结构信息数据库
Reconstructing rat cerebellum microstructure database using 3D Slicer
摘要目的:建立大鼠小脑外形三维重构的可视化数据集,为小脑中央核团的三维重建摸索一个可行的方案.方法:实验于2003-03/2005-05在首都医科大学解剖教研室实验室完成.取SD大鼠5只,麻醉后处死取小脑,固定后进行冰冻连续切片、贴片,后经尼氏染色,用扫描仪对各切片进行投射扫描,图像大小为(1 868×1 491),获取原始图像数据库,并通过首都医科大学生物工程学院开发的配准软件及图像处理软件photoshop 7.0对数据库中的数据进行半自动配准及人工分割,应用哈佛大学开发的图像处理专业软件3D Slicer对分割后的数据库进行三维重建.并应用牙科Cad-cam仪器对小脑外形进行扫描,获取完整的小脑外形图像.结果:①小脑尼氏染色获得的原始图像共159张,图像边缘清晰,可见深染的皮质和浅染的白质部分,白质间的小脑中央核深染,边界清晰.②共获得159个小脑外形的三维表面模型数据库(.vtk文件).在3D Slicer应用程序上可选择小脑外形的三维表面模型数据进行三维显示,并构建了它们的动画显示文件(.gif),使用Windows Media Player应用软件即可以播放;与应用牙科Cad-cam仪器对小脑表面扫描获取的小脑表面的图像比较,信息更饱满,图像更真实,层次感强.结论:通过切片、配准、分割等方法获得了大鼠小脑外形微细结构信息的数据库,此法更适用于组织微细结构的三维重建.
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分类号
R742（神经病学与精神病学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:1673-8225.2007.22.010
发布时间
2007-07-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
北京市教委科研项目（KM20071002507）
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