骨质疏松症蛋白质相互作用网络的构建和分子复合物通路预测

Construction of protein-protein interaction network of osteoporosis and prediction of pathways underlying molecular complexes

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摘要背景:在蛋白质相互作用网络的基础上研究骨质疏松症,可以更深入全面了解其发生发展机制.目的:建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,对其中所含分子复合物涉及的生物学通路进行预测.方法:筛选在线人类孟德尔遗传数据库中的骨质疏松症遗传相关基因,应用Cytoscape 软件和插件Agilent Literature Search,进行文本挖掘并建立骨质疏松症的蛋白质相互作用网络;应用插件Clusterviz,发现网络中的可能包含的分子复合物;基于DAVID,富集分子复合物的生物学通路.结果与结论:人类孟德尔遗传数据库中骨质疏松遗传相关基因有177 个.骨质疏松症的蛋白质相互作用网络包含863 个节点(蛋白质)、2 925 条边(相互作用关系),可能包含4 个分子复合物.其中分子复合物3 涉及免疫细胞表面分子及其相互黏附、细胞因子与其受体的结合、造血和止血功能等生物学通路;分子复合物4 与糖尿病的发生有一定关系.