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造血干细胞移植志愿捐献者罕见基因人类白细胞抗原C*08:99的测序分析

Sequencing analysis of a rare human leukocyte antigen, C*08:99, from a volunteer donor of hematopoietic stem cell transplantation

摘要背景:随着测序技术被广泛应用,器官移植配型的高分辨确认工作逐渐深入开展,人类白细胞抗原新等位基因不断涌现,但由于发现较晚,基因频率还不能准确计算,相关报道甚少,这些基因常被忽视,有时单纯根据基因频率判断分型结果,易造成分型结果的误判。目的:检测与分析1例造血干细胞移植志愿捐献者携带的罕见等位基因人类白细胞抗原C*08:99。方法:采用快速DNA提取试剂盒从全血样本中提取基因组DNA,经人类白细胞抗原C基因商品化测序分型试剂盒扩增,纯化后的扩增产物作为模板由试剂盒配套的第2,3和4外显子常规检测区正反向测序引物及自行研制的非常规检测区第5外显子正反向、第6外显子正向和第7外显子反向测序,经乙醇/醋酸钠/EDTA纯化的测序反应产物于ABI PrismTM 3730测序仪电泳检测,相关的Assign 3.6+分析软件予以人类白细胞抗原高分辨水平基因分型。结果与结论:①将电泳后的数据导入Assign-SBT 3.6+分析软件,得出的分型结果为C*07:04,08:99。②结果证实,临床移植配型人类白细胞抗原C基因分型增加第5,6,7外显子区域外的多态性检测可提高分型结果的准确性,对临床组织配型工作具有重要意义。

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作者 王大明 [1] 邹红岩 [1] 聂冬梅 [1] 高素青 [1] 王飞 [1] 学术成果认领
作者单位 深圳市血液中心免疫遗传室,广东省深圳市,518035 [1]
DOI 10.3969/j.issn.2095-4344.2016.01.018
发布时间 2016-05-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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