换一批绝经后骨质疏松症关联长链非编码RNA uc431+相互作用蛋白质组学分析
Interaction proteomics of long noncoding RNA uc431+ gene in postmenopausal osteoporosis
摘要背景:过表达LncRNA TUG1促进破骨细胞的增殖及抑制凋亡,采用siRNA敲低则取得了相反的结果,表明敲低LncRNA TUG1可能成为一个骨质疏松治疗的潜在靶点.目的:研究与绝经后骨质疏松症关联非编码RNA uc431+相互作用的蛋白组并进行生物信息学分析.方法:将甲醛交联的人单核细胞白血病细胞株(THP-1)细胞超声破碎,实验组与结合生物素标记的特异性探针的磁珠进行杂交,对照组与非特异性探针的磁珠进行杂交,获得的与非编码RNA uc431+结合的多肽进行质谱分析,获得的数据使用MaxQuant进行搜库和定量分析.对2组样品的定量结果进行统计学分析,得到对应的富集蛋白,并进行GO、KEGG通路、蛋白互作分析和展示,构建蛋白质相互作用网络.结果与结论:①获得的多肽总数为918条,蛋白总数为271个,过滤后蛋白总数为241个,与对照组相比,实验组差异蛋白为10个:DDOST、DMBT1、HPD、IGLL5、IGK、LTF、LYZ、MUC5AC、PIGR及RPL23;②GO富集分析表明,它们参与防御反应、白细胞激活等生物学过程及核糖体rRNA结合、溶菌酶活性等分子功能;③KeggG通路分析预测它们参与辅酶Q生物合成、苯丙氨酸代谢、核糖体信号肽及唾液分泌等信号通路;④结合蛋白质组学及生物信息学分析,预测绝经后骨质疏松症关联非编码RNA uc431+可能通过互作蛋白参与免疫调节及骨代谢过程.
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