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过表达线粒体蛋白磷酸酶2C对人肾小管上皮细胞转录组的影响

Effect of overexpression of protein phosphatase 2Cm on transcriptome of human renal tubular epithelial cells

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摘要背景:课题组前期研究发现相较于野生型小鼠,线粒体蛋白磷酸酶2C(protein phosphatase 2Cm,PP2Cm)基因缺失小鼠明显发生肾功能衰竭的症状,因此推测PP2Cm可能在肾脏纤维化发展过程中发挥重要保护作用,然而其分子机制尚不明确.目的:探究PP2Cm基因对于人肾小管上皮细胞转录组的影响.方法:培养人肾小管上皮细胞,用质粒将PP2Cm基因转染进入人肾小管上皮细胞,荧光定量PCR实验和Western blot实验检测细胞中PP2Cm的表达,随后分别提取细胞RNA进行转录组测序,寻找转染组和对照组之间的差异性表达基因,利用生物信息学方法进一步对所得的差异基因进行GO分析和KEGG分析.结果与结论:通过测序分析,与未转染空白细胞相比,在转染PP2Cm基因的人肾小管上皮细胞中存在796个差异性表达基因,其中553个下调基因,243个上调基因,GO分析结果显示,上调表达的基因显著富集在细胞生物合成过程、蛋白质翻译、内在凋亡信号通路等;下调表达的基因显著富集在内皮细胞增殖、细胞黏附等信号通路;KEGG分析结果显示,显著上调表达的基因富集在氨基酸代谢、生物合成等代谢相关信号通路;下调表达的基因显著富集在泛酸和辅酶A的生物合成等信号通路.结果表明,PP2Cm过表达可以影响肾小管上皮细胞的一系列生物学过程相关的多条信号通路,可能在氨基酸代谢、生物合成等代谢相关信号通路中起重要作用.

作者张丽 ^[1] 杨文君 ^[1] 桑晓红 ^[1] 韩媛媛 ^[1] 冒智捷 ^[1] 王顺 ^[1] 陆晨 ^[1] 学术成果认领

作者单位新疆医科大学第一附属医院肾脏病中心,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市 830011;新疆肾脏替代治疗临床研究中心,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市 830011;国家肾脏疾病临床医学研究中心新疆分中心,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市 830011;新疆维吾尔自治区血液净化质量控制中心,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市 830011;新疆维吾尔自治区肾脏病研究所,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市 830011 ^[1]

关键词肾小管上皮细胞 PP2Cm 转录组测序富集分析信号通路 renal tubular epithelial cell PP2Cm transcriptome sequencing enrichment analysis signaling pathway

分类号 R459.9（治疗学）R318（医用一般科学）R692.6（泌尿科学《泌尿生殖系疾病》）

栏目名称

细胞相关基础实验

DOI 10.12307/2023.915

发布时间 2023-12-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）