脊椎滑脱的潜在靶基因:基于欧洲人群生物数据库可成药基因组分析
Potential target genes for spondylolisthesis:drugable genome analysis based on the European population-based biodatabase
摘要背景:脊椎滑脱是一种常见疾病,目前缺乏有效的治疗药物,仍需要进一步明确脊椎滑脱的发病机制并筛选出更适合脊椎滑脱的治疗靶点.通过孟德尔随机化分析可以探索与脊椎滑脱相关的可成药基因,为开发更有效和靶向的治疗药物提供有价值的指导.目的:通过可成药全基因组的孟德尔随机化分析探索脊椎滑脱的潜在治疗靶点及有效治疗药物.方法:选择收录了50万名芬兰人的基因组和健康信息的芬兰数据库、eQTLGen联盟、药物特征数据库、药物-基因相互作用数据库、蛋白互作数据库、有机小分子生物活性数据库及蛋白质结构数据库,将可成药基因的顺式表达数量性状位点数据作为工具变量,进行孟德尔随机化分析和共定位分析,筛选得到与脊椎滑脱相关的显著可成药基因,随后进行GO与KEGG富集分析、蛋白质网络构建、药物预测和分子对接,以期为脊椎滑脱的新药开发提供帮助.结果与结论:发现34个与脊椎滑脱有显著关联的潜在药物靶点基因,其中特别值得注意的是基因APOBEC3G,它通过孟德尔分析和共定位分析显示出与脊椎滑脱结果的显著相关性,表明APOBEC3G可能是一个优先考虑的治疗靶点.至于其他潜在的机制和药物,仍需进行更深入的研究.此研究采用来自欧洲人群的数据库,对中国群体遗传学研究具有一定的借鉴意义.
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