换一批
换一批通过生物信息学方法分析脂肪酸合酶在肾透明细胞癌中的表达以及与肿瘤免疫细胞浸润的关系
Online database based analysis of fatty acid synthase expression in clear cell renal cell carcinoma and its relationship with tumor immune cell infiltration
摘要目的 通过生物信息学方法 探讨肾透明细胞癌(ccRCC)中脂肪酸合酶(FASN)基因和蛋白的表达水平及其与肿瘤免疫细胞浸润的相关性.方法 从癌症基因组图谱数据库检索FASN与ccRCC相关的表达谱数据,通过UALCAN数据库分析ccRCC中FASN基因表达水平及其与ccRCC患者临床病理分期、分级的相关性,使用基因表达谱动态分析网站分析FASN基因与ccRCC患者预后的相关性,使用人蛋白图谱数据库分析人组织中FASN蛋白表达水平,使用肿瘤免疫评估数据库和肿瘤微环境数据库分析FASN与肿瘤免疫的相关性,使用基因注释和分析数据库对FASN及相关基因进行功能富集分析.结果 在不同病理分期、分级ccRCC中FASN基因表达水平均显著高于正常组织,FASN基因高表达的患者预后较差.FASN蛋白S207和S2198位点磷酸化水平在ccRCC中显著降低.FASN表达与ccRCC中CD8+T免疫细胞浸润水平呈负相关,与调节性T细胞浸润水平呈正相关,免疫治疗会影响FASN与免疫细胞在ccRCC中共定位.FASN主要参与细胞脂质代谢、甾醇调节元件结合转录因子1激活基因表达、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、脂肪酸生物合成等生物功能.结论 FASN在ccRCC中高表达,且与ccRCC患者临床预后、肿瘤免疫细胞浸润相关.
更多相关知识
关键词
脂肪酸合酶肾透明细胞癌预后分析生物信息学免疫浸润Fatty acid synthaseKidney renal clear cell carcinomaPrognostic analysisBioinformatics methodsImmune infiltration
栏目名称
临床研究
DOI
10.3870/j.issn.1674-4624.2023.04.002
发布时间
2023-09-12
基金项目
国家自然科学基金
山西省工程重点创新团队建设计划
国家癌症中心重点课题
山西省研究生教育创新项目
山西省基础研究计划项目
北京白求恩公益基金
泌尿肿瘤专项研究基金
- 浏览79
- 被引0
- 下载27
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
