换一批ATP结合盒转运蛋白家族与膀胱癌免疫治疗效果的关联性分析
Analysis of the association between ATP-binding cassette transporter family and the efficacy of immunotherapy for bladder cancer
摘要目的 基于IMvigor210和UNC-108(GSE176307)数据集分析探讨ATP结合盒(ABC)转运蛋白家族在膀胱癌患者免疫治疗中的临床应用价值.方法 从IMvigor210数据集下载348例接受免疫治疗的膀胱尿路上皮癌患者的基因表达数据,将患者基于ABC转运蛋白家族基因表达水平进行共识聚类,分为聚类1和聚类2进行生存分析.通过单因素Cox回归分析筛选出对预后有影响的ABC转运蛋白家族基因,使用随机生存森林算法构建ABC评分预测模型,用于预测患者的生存期及免疫治疗反应,利用UNC-108数据集进一步验证模型的准确性.最后,采用ESTIMATE、ssGSEA算法评估患者的肿瘤微环境情况、oncoPredict算法预测患者对化疗药物顺铂的敏感性.结果 筛选出9个ABC转运蛋白家族基因用于构建ABC评分预测模型.在IMvigor210队列中,Kaplan-Meier生存分析显示 ABC评分低的患者总生存时间明显长于ABC评分高的患者(P＜0.001);ABC评分模型对患者0.5年、1年和1.5年生存预测的受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.80、0.87和0.88;ABC评分对免疫治疗效果的预测能力的AUC为0.78,高于肿瘤突变负荷(AUC:0.72)和程序性死亡受体配体1(AUC:0.58).ABC评分在UNC-108验证队列中也有着良好的预测效果.ABC评分与肿瘤微环境、多种免疫细胞、免疫表型、免疫评分、免疫检查点基因表达情况显著相关.结论 ABC转运蛋白家族与膀胱癌的肿瘤微环境、免疫治疗效果关系密切,有望成为膀胱癌免疫治疗的新型生物标志物.
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关键词
膀胱癌ATP结合盒转运蛋白免疫治疗肿瘤微环境基因预测模型生存分析顺铂bladder cancerATP-binding cassette transportersimmunotherapytumor microenvironmentgenepredictive modelsurvival analysiscisplatin
分类号
R737.14（泌尿生殖器肿瘤）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1009-8291.2024.12.002
发布时间
2025-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（No.82072822）
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