换一批apCAF通过趋化因子网络驱动肾透明细胞癌三级淋巴结构形成的空间多组学研究
The apCAF orchestrates tertiary lymphoid structure formation in clear cell renal cell carcinoma via chemokine networks:a spatial multi-omics research
摘要目的 分析肾透明细胞癌(ccRCC)中癌症相关成纤维细胞(CAF)的异质性谱系,并探讨抗原呈递CAF(apCAF)与三级淋巴结构(TLS)空间分布和形成之间的关系.方法 整合7个ccRCC单细胞测序转录组队列(n=88),运用Harmony算法校正批次效应,鉴定跨样本一致的CAF亚群;结合空间转录组(GSE175540,n=24)分析CAF与TLS的空间互作.采用AUCell进行功能注释,Wilcoxon检验比较免疫治疗敏感组与免疫治疗抵抗组的CAF丰度差异,同时评估TLS与不同趋化因子在空间上的共定位情况.结果 共定义了 9个保守CAF簇(Fibro0～8),跨队列可重复.其中Fibro 4高度激活apCAF评分,高表达HLA-DRA/CD74,在免疫治疗敏感组患者中Fibro 4占比较高,功能富集于T细胞活化通路,且与TLS存在较强的相关性,定位于TLS外围.细胞共定位分析发现,apCAF可通过CXCL13-CXCR5 轴和CCL19-CCR7轴招募淋巴细胞聚集从而形成TLS结构.结论 本研究首次揭示ccRCC中apCAF通过趋化因子网络驱动TLS形成,进而影响免疫检查点阻断疗法的治疗响应.apCAF-TLS轴为靶向基质重塑免疫微环境提供了新策略,其联合评分有望成为免疫治疗疗效预测的生物标志物.
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关键词
透明细胞肾细胞癌三级淋巴结构癌症相关成纤维细胞抗原呈递癌症相关成纤维细胞免疫治疗空间转录组分析clear cell renal carcinomatertiary lymphoid structurescancer-associated fibroblastantigen-presentation carcinoma-associated fibroblastimmunotherapyspatial transcriptomics analysis
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1009-8291.2025.11.006
发布时间
2025-12-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
上海市抗癌协会雏鹰计划资助项目（No.SACA-CY23C09）
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