脑脊液宏基因组学第二代测序在颅内感染诊断与治疗中的应用
Application effect of cerebrospinal fluid metagenomic next-generation sequencing in diagnosis and treatment of intracranial infection
摘要目的 探讨脑脊液宏基因组学第二代测序(mNGS)在颅内感染诊断与治疗中的应用价值.方法 纳入2020年1月至2022年12月广东省深圳市第二人民医院收治的117例颅内感染患者,均于启动经验性广谱抗生素治疗前收集脑脊液行微生物培养(常规培养组,58例)和(或)mNGS测序(mNGS组,59例),并根据结果回报调整抗生素治疗方案,对比两种检测方法的病原体检出率和结果回报时间、抗生素强度分级,以及重症监护病房(ICU)住院时间、总住院时间和病死率.结果 本组117例患者经脑脊液微生物培养和(或)mNGS测序共检出65种病原体,尤以病毒占比最高,为49.23%(32/65),其次依次为革兰阴性菌(24.62%,16/65)、革兰阳性菌(18.46%,12/65)和真菌(7.69%,5/65).脑脊液mNGS测序的病原体检出率高于(x2=22.781,P=0.000)、结果回报早于(t=-32.588,P=0.000)微生物培养;根据结果回报,mNGS组有20例(33.90%)调整抗生素治疗方案,抗生素应用强度降级5例、升级15例,常规培养组有30例(51.72%)调整抗生素治疗方案,抗生素应用强度降级17例、升级13例,组间差异无统计学意义(Z=-1.917,P=0.055);两组ICU住院时间(Z=-0.716,P=0.474)、总住院时间(Z=-0.933,P=0.351)和病死率(Fisher确切概率法:P=0.496)差异亦无统计学意义.结论 脑脊液mNGS测序可以有效提高颅内感染病原体检出率,尽可能减少广谱抗生素应用时间、降低抗生素总体应用强度,有助于临床准确诊断与精确治疗.
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