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基于网络药理学及分子对接探讨龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制

Exploring the Mechanism of the Action of Solanum nigrum and Herba Sarcandrae Herb Pair in the Treatment of Gastric Cancer Based on Network Pharmacology and Molecular Docking

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摘要目的本研究目的是通过网络药理学及分子对接方法探寻龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制.方法通过TCMSP数据库收集龙葵-肿节风药对活性成分;在TTD、DrugBank、Pharmgkb等疾病靶点数据库搜索汇总出胃癌基因靶点.利用Cytoscape软件构建"龙葵-肿节风药对活性成分—胃癌交集靶点"关系网络图.使用String数据库构建靶点蛋白相互作用网络(PPI)并用Cytoscape软件筛选出得出核心靶点.同时利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集从宏观角度分析核心靶点,并通过Autodock软件进行分子对接验证主要成分-核心靶点结合活性.结果我们确定了龙葵-肿节风药对主要的药物活性成分主要是槲皮素和β-谷甾醇;核心靶点分别为AKT1、TNF、IL6、TP53和IL1B.KEGG富集分析表明,PI3K-Akt信号通路及炎症相关信号通路可能是重要的通路.GO分析提示主要涉及的生物过程包括对激素的反应、细胞对氮化合物的反应、对异生刺激的反应等;参与的分子功能包括转录因子结合、蛋白质均二聚活性、蛋白质结构域特异性结合等;涉及的细胞组分主要是膜筏、转录调节复合体、质膜蛋白复合物等.分子对接结果表明,主要活性与核心靶点具有良好的结合活性.结论研究表明,龙葵-肿节风药对可能主要通过作用于AKT1、TNF、IL6、TP53和IL1B等靶点,进而调控PI3K-Akt通路、炎症等相关通路,从多靶点、多通路发挥治疗胃癌的作用.本研究为后续开展龙葵-肿节风药对抗胃癌的体内外实验研究奠定了基础.

作者陈丹媛 ^[1] 罗敏 ^[2] 高卓维 ^[1] 郝民琦 ^[3] 黄景彬 ^[1] 黄玉筠 ^[1] 朱亚莉 ^[1] 聂涛 ^[4] 陈锡传 ^[4] 龙德 ^[1] 林丽珠 ^[5] 学术成果认领

作者单位 528300 广州中医药大学顺德医院(顺德区肿瘤诊疗中心) ^[1] 510000 南方医科大学南方医院 ^[2] 510315 南方医科大学中西医结合医院 ^[3] 528300 龙德省名中医传承工作室 ^[4] 528300 广州中医药大学顺德医院(顺德区肿瘤诊疗中心);510405 广州中医药大学第一附属医院岭南肿瘤研究所 ^[5]

关键词网络药理学分子对接龙葵肿节风 PI3K-Akt信号通路药对 Gastric cancer Network Pharmacology Molecular Docking Solanum nigrum Herba Sarcandrae PI3K-Akt signaling pathway Couplet medicines

分类号 R573（消化系及腹部疾病）

栏目名称

基础研究

DOI 10.3969/j.issn.1672-2159.2023.09.011

发布时间 2024-01-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

广东省自然科学基金区域联合基金项目（2019A1515110416）广东省中医药局广东省中医师承薪火工程号) 龙德省名中医传承工作室项目林丽珠省名中医传承工作室项目