换一批
换一批小麦过敏原Tri a Bd 27k蛋白抗原表位预测及三维结构模拟
Prediction of epitopes and three-dimensional structure modeling from triticum aestivum allergen Tri a Bd 27k
摘要目的 通过生物信息学方法了解小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构特征,为小麦变态反应性疾病的诊断和预防提供依据.方法 在Uniprot数据库中获得Tri a Bd 27k蛋白序列,通过DNAStar预测B细胞抗原表位,NetMHCⅡ和Syfpeithi预测T细胞抗原表位;使用Swiss-Model软件预测其三维结构并用Ramachandran进行稳定性评估.在Uniport 数据库搜索Tria Bd 27k的同源蛋白,应用Clustalx 1.83及Mega 3.1构建同源进化树.结果 小麦过敏原Tri a Bd 27k的B/T细胞共同抗原表位优势区域为34-42、102-117,Ramachandran软件预测结果显示小麦Tri a Bd 27k蛋白的空间构象稳定.结论 通过对小麦过敏原Tria Bd 27k进行生物信息学分析获得了该过敏原优势区域及三维结构模型,为进一步了解和掌握小麦过敏原Tri a Bd 27k的结构功能打下理论基础.
更多相关知识
关键词
小麦过敏原Tri a Bd 27k抗原表位三维结构Triticum aestivum allergenTri a Bd 27kEpitopeThree-dimensional structure
分类号
R392.1
栏目名称
实验技术及其应用
发布时间
2013-09-03
基金项目
广东省医学科研基金课题
国家自然科学基金项目
国家科技重大专项
- 浏览284
- 被引2
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
