贵州省20例水痘患者水痘-带状疱疹病毒基因型分析

Genotype analysis of varicella-zoster virus among 20 varicella cases in Guizhou province

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摘要目的了解贵州省20例水痘患者流行的水痘-带状疱疹病毒(vzv)主要基因型别,为水痘疫情的防控提供科学依据.方法收集20份临床诊断水痘患者血清标本、咽拭子或水疱液标本,分别用ELISA法检测VZV IgM抗体、实时荧光定量PCR检测VZV特异性核酸、普通PCR扩增VZV开放阅读框(ORF) 22核酸片段,用BioEdit和MEGA 4软件分析测序结果,并与Genbank上VZV参考株序列比较,进行生物信息学分析.结果 20份临床诊断病例VZV IgM抗体检测均为阳性,其中7份咽拭子或水疱液标本实时荧光定量PCR检测为阳性,3例标本的PCR产物在约447bp处有明显目的条带,测序证实为水痘-带状疱疹病毒.ORF22基因的单核苷酸多态性(SNP)分析显示,GZVZV001和GZVZV007核酸片段完全一致,GZVZV002序列在37922位点出现R碱基取代G碱基.3株分离株序列与J基因型参考株p-OKa序列比较,一致性为99％～100％,与E基因型参考株DUMAS序列比较,在6个关键位点上有4个碱基不一致,与M1基因型参考株CA123比较,6个关键位点上有3个碱基不一致.提示3株分离株为VZV J基因型.结论贵州省目前VZV流行的野毒株型别中存在J基因型,加强VZV疫苗的接种能有效防止水痘的爆发流行.