2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒基因特征分析
Genetic characterization of influenza A (H1N1) virus in Shaanxi in 2017-2018
摘要目的 了解陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因变异情况.方法 选取2017-2018年度分离的6株甲型H1N1流感毒株进行全基因测序,利用生物信息学软件对分离株的HA和NA基因进行进化和变异分析,并与北半球疫苗株A/Michigan/45/2015进行对比;采用MEGA(5.05)软件NJ法构建基因进化树,进行系统进化分析.结果 陕西省2017-2018年度甲型H1N1流感病毒阳性占比36.85%,流行高峰为2017年12月和2018年1月.6株甲型H1N1流感病毒测序得到的HA、NA序列与疫苗株比对,分别有12、11个氨基酸位点发生变异,其中HA有7个位点变异发生在抗原决定簇,受体结合位点、潜在糖基化位点比较稳定;NA序列没有发现耐药位点变异.结论 2017-2018年度陕西省甲型H1N1流感病毒为优势流行株.目前甲型H1N1流感病毒与WHO推荐的新疫苗株高度同源.
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