换一批2016年6月至2017年4月辽宁省人感染H7N9禽流感病毒HA和NA基因特征分析
Genetic characteristic of hemagglutinin and neuraminidase of human infected with H7N9 avian influenza virus,Liaoning,June 2016-April 2017
摘要目的 本文对2016-2017年辽宁省人感染H7N9禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因遗传进化特征分析.方法 使用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对选取的4株H7N9禽流感病毒株HA和NA基因进行扩增并测序,用生物信息学软件分析其基因进化变异特征.结果 2016年6月至2017年4月辽宁省4株毒株的HA和NA基因与WHO最新推荐的A/Hunan/02650/2016疫苗株的同源性最高,其HA基因的核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分别为99.3％～99.6％,99.8％～100％;NA基因的核苷酸和蛋白氨基酸序列同源性分别为97.7％～99.7％;98.3％～99.6％.本省所有毒株均属长江三角洲谱系,但主要聚集在两个次分支.4株病毒HA蛋白裂解位点333-342氨基酸序列均为PEIPKGR ↓ GLF,在338-339位点无连续的多个氨基酸插入(KRTA),属于低致病性禽流感病毒分子特征.HA受体结合位点均出现S138A、G186V、Q226L、T221P氨基酸的突变,NA茎部区均出现"Q1SNT"缺失,且NA蛋白上相关耐药位点上的氨基酸并未发生突变,3株毒株NA蛋白上糖基化位点第42位发生氨基酸序列NCSH→NCTH突变.结论 2016-2017年辽宁省人感染H7N9禽流感病毒HA和NA基因关键位点氨基酸发生突变,使病毒具有双受体结合特性以及毒力增强.
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