淮安市临床分离金黄色葡萄球菌耐药性及全基因组测序分析

Drug resistance and genome sequencing analysis of staphylococcus aureus isolated from clinical isolates in Huai'an city

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摘要目的探究淮安市临床分离金黄色葡萄球菌的耐药性及分子流行病学特征,为其感染的诊治和防控提供参考.方法收集从临床标本中分离的金黄色葡萄球菌,通过头孢西丁或苯唑西林耐药表型或mecA基因检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA).采用微量肉汤稀释法进行药敏试验.基于全基因组测序,对菌株进行单核苷酸多态性分析和多位点序列分型.利用在线数据库鉴定菌株携带的毒力和耐药基因.结果从7种类型临床标本中共分离到83株金黄色葡萄球菌,MRSA占59.04％.分离菌株对青霉素耐药率最高,为97.59％,对奈唑胺、替加环素、万古霉素、替考拉宁和呋喃妥因均敏感,多重耐药菌株占57.83％.83株金黄色葡萄球菌有20个ST型,ST398(21.69％)为主要型别.83个基因组存在187 292个SNPs位点.这些菌株携带有38种耐药基因,其中tet(38)、blaZ、arlR、arlS、mgrA、norA、mepA、ErmC、LmrS、mepR 携带率较高.携带 sea、seb、sec、sed、seh、selk、sell、selq 8 种肠毒素基因,selk和selq携带率最高,均为32.53％,ST1菌株携带肠毒素基因种类最多.杀白细胞素PVL编码基因lukF-PV和lukS-PV携带率分别为49.40％和6.02％.中毒性休克综合征毒素TSST-1编码基因tsst-1的携带率为3.61％.结论淮安地区临床分离金黄色葡萄球菌的耐药性较强,MRSA检出率较高.菌株ST型别丰富,ST型别与致病性存在一定相关性.

作者 李兵兵 ^[1] 汪浩 ^[2] 杨鹏飞 ^[1] 宋志洲 ^[3] 孙敏 ^[1] 邢亚东 ^[1] 学术成果认领

作者单位 淮安市疾病预防控制中心,江苏淮安 223001;淮安市突发公共卫生事件应急检测重点实验室,江苏淮安 223001 ^[1] 涟水县疾病预防控制中心,江苏淮安 223400;淮安市突发公共卫生事件应急检测重点实验室,江苏淮安 223001 ^[2] 涟水县疾病预防控制中心,江苏淮安 223400 ^[3]

关键词金黄色葡萄球菌耐药性分子流行病学 Staphylococcus aureus Drug resistance Molecular epidemiology

分类号 R378.11 R446.5

栏目名称 实验技术及其应用

DOI 10.20043/j.cnki.MPM.202312350

发布时间 2024-06-12

基金项目

江苏省预防医学科研课题 淮安市创新能力建设计划