基于网络药理学和分子对接探索脑栓通胶囊治疗脑梗死的潜在机制研究
Study on the potential mechanism of naoshuantong capsule in treating cerebral infarction based on net-work pharmacology and molecular docking
摘要目的 采用网络药理学和分子对接技术探讨脑栓通胶囊治疗脑梗死的可能作用机制.方法 基于TC-MSP数据库筛选得到脑栓通胶囊的主要有效成分和靶标.同时通过GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD和DrugBank数据库收集脑梗死相关靶标,并利用InteractiVenn平台取药物与疾病的交集靶标.利用Cytoscape软件构建"活性成分-疾病靶点"网络模型.运用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络图,根据相互关系大小筛选核心靶标.运用R语言对交集靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析.最后运用AutoDock Vina和Pymol将"活性成分-疾病靶点"网络中的活性成分与蛋白靶点进行分子对接.结果 收集脑栓通胶囊活性成分23 种,相关潜在靶点264 个;脑梗死相关靶点2 043 个;取两者交集得到共同靶点 149 种.主要作用于JUN、TNF、IL6 和NFKBIA等多个靶标,靶点主要涉及TNF信号通路、IL-17 信号通路、NF-κB信号通路和细胞死亡等通路以发挥治疗脑梗死作用.分子对接结果显示,网络中药物的活性成分与靶点蛋白结合较好.结论 本研究通过网络药理学、分子对接以及生物信息学分析初步揭示了脑栓通胶囊多成分、多靶点、多通路治疗脑梗死的潜在机制.
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