换一批
换一批基于TCGA数据库肺腺癌自噬相关基因预后模型的建立与验证
Establishment and validation of a prognostic model for autophagy related genes in lung adenocarcinoma based on TCGA database
摘要目的 探究肺腺癌自噬相关基因(ARGs),并构建肺腺癌ARGs的预后模型.方法 肺腺癌的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库和人类自噬基因(HADb)数据库,获取ARGs,并基于肺腺癌差异表达ARGs构建肺腺癌预后模型并验证,进一步构建列线图及校准曲线探究模型在临床中的应用价值.对差异表达ARGs进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析.对获得的具有预后意义的差异表达ARGs进行Lasso回归分析并构建肺腺癌预后模型.绘制Kaplan-Meier生存曲线.结果 共获得31个差异表达ARGs,筛选得到10个具有预后意义的差异表达ARGs.高风险组患者与较差的总生存期明显相关,差异有统计学意义(P<0.05).T分期、N分期、风险评分为肺腺癌患者的独立预后因素.校准曲线和列线图全局一致性为0.710,说明模型预测结果与实际情况具有较高的符合度.结论 基于差异表达ARGs构建的风险模型可作为肺腺癌患者的一种预后特征或可为肺腺癌患者的个体化治疗提供参考依据.
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关键词
肺腺癌自噬相关基因预后模型癌症基因组图谱数据库计算生物学Lung adenocarcinomaAutophagy-related genesPrognosis modelThe Cancer Ge-nome Atlas databaseComputational biology
分类号
R734.2
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1009-5519.2024.10.001
发布时间
2024-06-18
基金项目
山东省医药卫生科技发展计划项目（202203100054）；
青岛西海岸新区科技惠民项目（2020-44）
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