2023年深圳地区182例手足口病和疱疹性咽峡炎患儿肠道病毒优势血清型VP1基因特征分析
VP1 gene characteristics of predominant enterovirus serotype of 182 hand,foot,and mouth disease and herpangina patients from Shenzhen in 2023
摘要目的 调查2023年深圳地区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)/疱疹性咽峡炎(herpangina,HA)患儿肠道病毒血清型分布情况,分析优势血清型的进化特征.方法 采集2023年深圳市宝安区妇幼保健院和深圳市妇幼保健院182例HFMD/HA患儿粪便或咽拭子样本,利用荧光定量PCR方法检测肠道病毒,阳性样本利用PCR-基因测序法分型,根据分型结果得出优势血清型,利用PCR-基因测序法获得优势血清型的VP1基因编码区序列全长,再利用MEGA X软件构建系统发育进化树,利用Bioedit软件进行序列相似性分析.结果 182份样本肠道病毒检出率为62.1%(113/182),优势血清型为柯萨奇病毒A组6型(Coxsakie virus A6,CV-A6),系统发育进化树显示CV-A6可分为4个谱系(A~D),2023年深圳分离株均属于谱系D中的D3a亚支,与谱系A~C代表株的核苷酸、氨基酸相似性分别为82.0%~85.1%、93.7%~96.7%.结论 CV-A6是2023年深圳地区HFMD/HA患儿肠道病毒的优势血清型,其基因分型属于当前全球流行的D3a亚支.
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