换一批
换一批三阴性乳腺癌m6A相关lncRNA的免疫预后模型构建
Immunoprognostic Model Construction of m6A-Associated lncRNAs in Triple-Negative Breast Cancer
摘要三阴性乳腺癌(TNBC)是一种特殊的乳腺癌亚型.因其异质性以及缺乏可靠的分子靶点使其无法获得有效靶向治疗,导致TNBC患者的存活率仍然很低.N6-甲基腺苷(m6A)和长链非编码核糖核酸(lncRNA)在TNBC的预后价值和免疫治疗反应中起着至关重要的作用.因此,辨别TNBC患者中与m6A相关的lncRNA至关重要.通过共表达的方式分析并获得m6A相关的lncRNA,之后进行单变量比例风险(Cox)回归分析、随机生存森林(RSF)、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)和多变量Cox回归分析以构建m6A相关lncRNA模型.随后使用卡普兰-梅尔(KM)生存分析、主成分分析(PCA)、功能富集分析和列线图分析风险模型.最后,讨论了针对该模型的潜在免疫治疗特征和药物敏感性预测.包含3个m6A相关lncRNA的风险模型被确定为预后的独立预测因子.通过使用该模型对患者进行重新分组,可以对患者在免疫治疗反应方面进行更有效的区分.使用pRRhetic算法根据每个样本的癌症药物敏感性基因组学(GDSC)数据库中可用的半数最大抑制浓度(IC50)估计治疗反应,确定了针对TNBC亚型分化的候选药物.结果表明,这种基于m6A的lncRNA风险模型有望用于临床预测TNBC患者的预后和免疫治疗反应.
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关键词
N6-甲基腺苷lncRNAs三阴性乳腺癌预后模型免疫治疗N6-methyladenosinelncRNAstriple-negative breast cancerprognostic modelimmunotherapy
栏目名称
生命科学与技术
DOI
10.13568/j.cnki.651094.651316.2023.03.17.0001
发布时间
2024-02-03
基金项目
新疆维吾尔自治区杰出青年科技人才培养项目
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