换一批透明细胞肾细胞癌长链非编码RNA表达谱分析及初步验证
The expression and validation of lncRNA expression profile in clear cell renal cell carcinoma
摘要目的 探讨及分析透明细胞肾细胞癌(ccRCC)长链非编码RNA(lncRNA)的表达谱,并进行初步验证.方法 利用高通量lncRNA芯片技术分别检测3例ccRCC组织及对应癌旁组织中lncRNA表达谱的差异,对芯片结果进行基因本体论(Gene Ontology)分析,Pathway分析,建立lncRNA与靶基因的基因网络图,并利用实时荧光定量RT-PCR技术对高通量lncRNA芯片检测结果进行验证.结果 ccRCC患者癌组织与癌旁对照样本差异表达的lncRNA共3 862条,其中1 619条上调表达,2 243条下调表达(差异表达倍数≥2.0, P <0.05).荧光定量RT-PCR结果显示,筛选出的6个lncRNA,在87例ccRCC样本中的表达差异与芯片检测结果一致.结论 ccRCC存在明显的lncRNAs差异性表达,这些lncRNAs及某些信号通路可能在肾癌发生和发展中发挥重要作用.
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