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5株水禽细小病毒全基因组序列分析

Complete Genomic Sequences Analysis of Five Waterfowl Parvoviruses

摘要利用PCR技术扩增鹅细小病毒(GPV) ZJ、G3和LJY毒株与番鸭细小病毒(MDPV) DK和DYL毒株全基因组.序列分析结果表明,除LJY毒株非结构基因(NS)编码626个氨基酸外,其余4株NS全长1 884 bp,编码627个氨基酸;5株的结构基因(VP)全长均为2 199 bp,编码732个氨基酸.GPV、MDPV NS蛋白不同毒株之间相似性分别为95.9%~99.8%和96.8%~99.0%;而GPV与MDPV NS蛋白之间相似性为88.9%~90.4%.GPV、MDPV VP蛋白不同毒株之间的相似性分别为90.2%~100.0%和96.9%~99.3%,而GPV与MDPV VP蛋白之间的相似性为79.5%~81.6%,表明GPV抗原性不同于MDPV.MDPV与GPV NS蛋白均含有4个潜在的糖基化位点;在结构蛋白区域,MDPV VP含有8个潜在的糖基化位点,而GPV为6个糖基化位点,G3与LJY毒株分别缺失582-584 NTT和703-705 NRT潜在的糖基化位点.5株水禽细小病毒的进化分析表明,GPV、MDPV在进化上形成两个独立的分支,各个基因片段之间未发生重组.

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