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德保矮马X染色体选择信号筛选

Detecting Selection Signatures on X Chromosome of Debao Pony

摘要旨在对德保矮马(Debao pony)X染色体的选择信号进行筛选.本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65K SNP BeadChip,对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描,获得2 339个SNPs位点.通过群体分化系数FsT法和XP-EHH两种不同的方法,分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测.结果,筛选到两个受到较强选择区域4.0~39.9和87.1~123.5 Mb,包含64个“离群位点”.通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因.研究结果发现,德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择,其中部分在马中未见报道,可以作为研究矮小性状的重要候选基因.

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分类号 S821S821.21
栏目名称
DOI 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.12.006
发布时间 2016-09-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
科技创新项目(ASTIP-IAS01) 国家自然科学基金(31272403)
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畜牧兽医学报

畜牧兽医学报

2015年46卷12期

2161-2168页

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