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兔粪中微生物区系ERIC-PCR DNA指纹图谱的建立及分析

Establishment and Analysis of ERIC-PCR DNA Fingerprint of Bacteria in Rabbit Manure

摘要本研究旨在将ERIC-PCR基因指纹图谱技术应用于兔粪微生物的分析中,建立一种快速分析检测兔肠道菌群变化的方法.通过对PCR反应条件的优化确定适合兔粪微生物的ERIC PCR反应条件,对比兔粪微生物组和兔粪优势菌的ERIC-PCR DNA指纹图谱差异,从而分析兔粪微生物ERIC指纹图谱的特征.结果建立了适合兔粪样品ERIC-PCR分析的反应体系,确定450 bp处条带为双歧杆菌特征条带,1 300和4 000 bp处为大肠杆菌特征条带;经发酵验证,图谱中的相应条带亮度变化趋势与计数平板所测结果相一致(相对亮度R与相对菌落数lg cfu的相关系数为0.967 6).本研究优化建立了一种快速分析检测兔粪中菌群变化的ERIC-PCR指纹图谱技术,该技术可较好反映兔粪中优势菌含量的变化情况,为兔肠道疾病的预防、诊断和治疗提供依据.

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