换一批绵羊不同部位脂肪组织microRNA高通量测序及生物信息学分析
High-throughput Sequencing and Bioinformatics Analysis on microRNAs Expressed in Adipose Tissues of Sheep
摘要本研究旨在挖掘绵羊不同脂肪组织中特异表达的miRNAs.构建肾周(PEF)、皮下(SUF)和尾部(TAF)脂肪组织的3个小RNA文库,利用Solexa测序技术进行测序,用Stem-loop qRT-PCR技术和生物信息学方法对测序结果进行验证和分析.结果表明,8个随机选择的miRNAs中有7个miRNAs的表达与测序结果一致.在肾周和皮下脂肪组织的sRNA文库中分别检测到128和112个保守miRNAs,分别发现198和196个新miRNAs.结合前期在尾脂中检测到miRNAs的分析结果,肾周脂肪中特异表达的有12个保守的和66个新miRNAs;皮下脂肪中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和30个;尾脂中特异表达的保守和新miRNAs分别为1个和34个.上述结果将为进一步研究miRNA调控绵羊的脂肪代谢提供科学依据.
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关键词
绵羊脂肪组织microRNASolexa测序生物信息学方法sheepadipose tissuesmicroRNASolexa sequencingbioinformatics methods
栏目名称
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2016.06.003
发布时间
2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31372292）
山西省研究生优秀创新项目（2015SY28）
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