换一批牦牛新鲜囊胚与玻璃化冻融囊胚转录组的比较分析
Comparative Transcriptome Analysis between Fresh and Vitrified-thawed Blastocysts of the Yak (Bos grunniens)
摘要旨在探讨牦牛在囊胚玻璃化冷冻前后转录组差异表达,明确玻璃化冷冻对牦牛囊胚基因表达谱的影响.采用体外受精生产的牦牛新鲜囊胚和玻璃化冻融囊胚为研究对象,分别提取总RNA,使用Smart-seq2方法进行扩增、构建文库、转录组测序(RNA-seq),以|log2(冻胚/鲜胚)|≥1和Q＜0.05为阈值筛选差异表达基因(DEG),并对DEGs进行GO功能富集和KEGG分析.结果表明,冷冻前后牦牛囊胚中分别检测到9 827和13 567个转录本.在两个文库共筛选出11 174个DEGs,其中有7 037个在冻融囊胚上调,4 137个下调.有10 538个DEGs显著富集(P＜0.05)到479条GO terms上,共涉及318条通路,其中真核生物的核糖体合成、剪接体和神经活性配体-受体互作等8条通路显著富集(P＜0.05).本研究利用RNA-seq技术分析了牦牛囊胚在玻璃化冷冻前后转录组变化,为探讨牦牛囊胚冷冻损伤机制及进一步完善冷冻方法提供理论依据.
更多相关知识
分类号
S823.8+5.2
栏目名称
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2018.04.007
发布时间
2018-06-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
中央高校基本科研业务费专项资金项目（(2015NZYTD02)）
- 浏览5
- 被引12
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
