换一批富营养饮食重塑代谢性疾病易感猪关键组织mRNA剪接模式研究
Study on the mRNA Splicing Pattern Reshaped by the Nutritious Diet in Key Tissues of Metabolic Disease Susceptible Pigs
摘要旨在探讨富营养饮食对代谢性疾病易感猪关键组织可变剪接(alternative splicing,AS)和剪接因子(spli-cing factors,SFs)的影响.本研究以健康状态、月龄和体重相同的12头代谢性疾病易感公猪为材料,随机将其分为两组,其中8头猪饲喂高脂高能量饲料2个月作为富营养饮食组(TG-HFHSD),4头猪饲喂正常饲料2个月作为对照饮食组(TG-CD).对TG-HFHSD和TG-CD的脂肪、肝、肌肉和下丘脑组织进行RNA-seq测序,利用rMATS软件鉴定组间差异AS,对差异剪接基因(differential splicing genes,DSGs)进行GO和KEGG富集分析,并利用DESeq2软件和皮尔逊相关性系数分析肝组织中的SFs.结果显示,脂肪、肝、肌肉和下丘脑中分别鉴定到48 279、39 536、47 888和52 210个AS事件,均以SE类型为主,占比在77.09％～78.29％之间.脂肪、肝、肌肉和下丘脑中的DSGs数分别为528、1 070、570和600个,其中肝增加的DSGs部分主要是RI和MXE两种类型,分别为177和471个,而其它组织仅为12～28个和99～110个.GO和KEGG富集显示,肝DSGs除富集到细胞结构相关的过程外,还显著富集到可变剪接及mRNA代谢、脂质代谢、DNA损伤及修复、补体与凝血级联等过程.肝中筛选到56个差异表达的SFs,其中CLK1、PGC-la、USP4等与糖脂代谢和代谢性疾病密切相关.本研究表明,富营养饮食显著增加了肝DSGs,通过剪接调控、糖脂代谢以及DNA损伤来影响肝代谢性疾病的发生,将为肝代谢性疾病早期发生机制研究提供参考.
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