换一批基于生物网络功能模块整合组方规律分析四黄止痢颗粒治疗仔猪腹泻的作用机制
Analysing the Mechanism of Sihuang Zhili Granule in the Treatment of Piglet Diarrhea Based on Biological Network Function Modules and Compatibility Rules
摘要从功能模块水平研究中药复方四黄止痢颗粒治疗仔猪腹泻的分子作用机制,并阐释其配伍规律.使用TCMSP、TCMID、HERB数据库筛选方中黄连、黄柏、大黄、黄芩、板蓝根、甘草6味中药的有效成分,收集相关药物靶点;使用GeneCards、NCBI、OMIM数据库获取仔猪腹泻的疾病靶点;比较分析药物靶点和疾病靶点的交集并用韦恩图表示,将其上传至STRING数据库进行蛋白相互作用分析;采用Cytoscape软件绘制靶点蛋白相互作用网络图(protein-protein interaction network,PPI);应用MCODE插件对PPI网络进行功能模块识别;运用David数据库对功能模块进行KEGG通路富集分析.结果表明:1)网络分析筛选活性成分180个,主要包括生物碱、黄酮、蒽醌、苷类成分;药物靶点蛋白88个,猪腹泻相关靶点470个,二者的交集靶点35个.2)蛋白互作网络分析表明,由17个靶点蛋白组成的模块1是中药复方四黄止痢颗粒的功能模块.3)KEGG富集分析表明,模块1主要涉及的通路包括TNF、IL-17以及NF-κB等17个信号通路.4)归经分析表明,四黄止痢颗粒主要作用于脾、胃等11个脏腑经络.综上所述,生物碱、黄酮、蒽醌、苷类成分是四黄止痢颗粒的物质基础,主要通过作用于功能模块1调控TNF、IL-17、NF-κB等信号通路,调节脾、胃等脏腑经络,从蛋白靶点、信号通路以及经络等多个水平上发挥治疗仔猪腹泻的作用.
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关键词
生物网络功能模块四黄止痢颗粒仔猪腹泻作用机制biological networkfunctional moduleSihuang Zhili granulepiglet diarrheamech-anism
分类号
S853.9
栏目名称
DOI
10.11843/j.issn.0366-6964.2023.07.034
发布时间
2023-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
农业部重点实验室开放基金（KLFB-FRI-202104）
中国农科院创新工程联合攻关重大科研任务（CAAS-ZDRW202111）
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