摘要旨在研究水通道蛋白9(aquaporins9,AQP9)及核糖体蛋白10(ribosomal protein S10,RPS10)基因多态性及其与北京黑猪背膘厚的相关性,以期能够获得北京黑猪背膘厚的有效标记.本研究以413头北京黑猪为研究对象,测定不同部位(肩部、6-7肋间、胸腰结合、腰荐结合)的背膘厚度.PCR扩增AQP9和RPS10基因的启动子区和外显子区序列筛选SNP位点,并将SNPs与各部位背膘厚进行关联分析.运用荧光定量PCR检测基因的差异表达.结果发现,AQP9基因启动子区有4个突变位点,其中1个SNP:rs332699245 A＞C与胸腰结合处背膘厚关联显著(P＜0.05),且该位点突变预测到了结合转录因子的改变;RPS10基因在3'UTR、CDS区共有8个突变位点,其中5个与背膘厚显著关联:rs80795904 C＞G、rs80932213 T＞C与6～7肋间背膘厚关联显著(P＜0.05),rs3469834461 C＞T与肩部背膘厚、四点平均背膘厚关联显著(P＜0.05),rs80862457 C＞T与胸腰结合处背膘厚、腰荐结合处背膘厚关联显著(P＜0.05),rs336938272 A＞C与6～7肋间背膘厚、腰荐结合处背膘厚、四点平均背膘厚均关联显著(P＜0.05);且在3'UTR区检测到1个SNP(rs80862457 C＞T),位于小RNA(microRNA,miRNA)结合靶点.基因表达差异分析表明,rs332699245 A＞C中AA型个体的AQP9基因mRNA水平显著高于AC型个体(P＜0.05),rs80862457 C＞T中TT型个体的RPS10基因mRNA水平显著高于CC型个体(P＜0.05).综上所述,AQP9和RPS10基因与北京黑猪背膘厚显著关联,rs332699245 A＞C和rs80862457 C＞T位点可作为北京黑猪背膘厚选育的潜在分子标记,为北京黑猪的选育提供理论支撑.