首页 > 畜牧兽医学报 > 基于转录组测序研究绿光影响鹅胚心脏早期发育的候选基因

基于转录组测序研究绿光影响鹅胚心脏早期发育的候选基因

Study on Candidate Genes for Green Light Affecting Early Development of Goose Embryo Heart Based on Transcriptome Sequencing

二维码有效期 120s

摘要旨在通过分析鹅胚心脏在绿光光照刺激下的基因表达差异,挖掘心脏发育的候选基因.本研究将512枚鹅种蛋,随机均分在正常黑暗孵化以及补充绿光的两台孵化机中,每台孵化机内放置4层(64枚·层-1),绿光孵化机提供15 min开灯和15 min关灯的间歇光照.在孵化第13、16、20、24、28和30天时,每组随机挑选种蛋8枚,称取胚胎重量,分离胚胎心脏组织并称重;采集孵化第13天的胚胎心脏组织(每组各3),进行转录组测序(RNA-Seq),筛选差异表达基因(DEGs)并进行功能富集分析,鉴定与绿光促进心脏发育相关的候选基因.并通过荧光定量PCR(qRT-PCR方法)验证测序结果的可靠性.结果表明:绿光显著提高16和30胚龄胚重比例(胚胎重/入孵蛋重×100)(P＜0.05),以及13和16胚龄心脏指数(心脏重/胚胎重×100)(P＜0.05).心脏转录组测序分析共筛选出1 643个DEGs.随机选择7个DEGs进行RT-qPCR验证,表达趋势与测序结果一致.功能富集分析表明,DEGs主要涉及PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路等通路,最终筛选出GATA4、GATA5、Smad4和GHR这4个候选基因.对它们在不同胚龄阶段心脏组织中的mRNA表达量进行分析,其表达模式进一步表明了其在绿光调控心脏发育过程中的作用.本研究发现,鹅蛋孵化期绿光处理促进了胚胎和心脏发育,进一步通过心脏组织转录组数据分析,鉴定到了4个鹅胚心脏发育候选基因GATA4、GATA5、Smad4和GHR,为鹅胚心脏组织发育的分子调控机制提供了线索,并为绿光应用于鹅种蛋孵化提供了理论基础.